研发疫苗新升级!AI助力攻坚新冠疫苗研发

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视频介绍

2月4日,一篇刊登于顶级医学期刊《柳叶刀》的文章表示,借助深度学习和知识图谱,研究者发现经典JAK激酶抑制剂巴瑞替尼(Baricitinib)或可用于治疗新型冠状病毒肺炎。而这次用于寻找潜在药物的技术是BenevolentAI的知识图谱。这是一个大型的结构化医药信息仓库,包括了大量使用机器学习抽取出来的连接关系。根据新冠病毒的特点,研究者使用该知识图谱验证可以帮助治疗的药物——即那些能够阻断病毒感染进程的药物。AI算法在新药/疫苗研发领域的作用,正是提升效率。人工智能比传统的方法更有优势的地方,在于利用机器学习、人工智能的方法,能够在在非常早期,对未来将会成为药物的这些分子同时进行相对全面的判断,也就能提前筛掉后续实验会失败的分子。国内受到关注的案例就是我们上面提到的百度LinearFold线性算法。根据世界卫生组织(WHO)资料显示,引发此次疫情的病毒2019-nCoV,是一种具外套膜(envelope)的正链单股RNA病毒,RNA(核糖核酸)冠状病毒,直径约80~120nm。确定此类疾病重要的检测手段,便是通过核酸检测方式提取疑似病例血液中核酸序列,并与目标病毒比对,即可基本确定有无病原体感染。然而,疑似病例的病毒样本进行全基因组序列分析比对费时费力,而借助AI可代替人力完成初筛工作,大幅提高检测效率。百度LinearFold线性算法于2019年7月首次提出,该算法使得整序列、整基因组的RNA结构预测成为可能,也是RNA结构预测领域40年来第一次重大提速。2020年1月30日,百度向科研机构免费开放了这项世界上现有最快的RNA结构预测网站及算法。算力及算法对于疫情防控的重要性在于,新药和疫苗研发期间需要进行大量的数据分析、大规模文献筛选和科学超算工作。因此,我们看到百度之外,商汤科技1月24日为国家重点研发计划首席科学家、中山大学药学院罗海彬教授提供了算力支持;阿里云则是在1月29日宣布向全球公共科研机构免费开放一切AI算力。

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